А воздух как поступает в бак. У меня на моторной лодке в этом году такой эфект был. причина была в подаче воздуха в бак. у меня два бака и сначала между собой соеденены шлангом а потом выведен шланг за перегородку в район транца, чтоб бензином не пахло, было так на ходу после минут 40 падала мощность, сбрасывал газ поработав немного на холостых давал газу снова какоето время ехал, перешел на другой бак все прошло. Дома разобрал все а причина была в пережатом воздушном шланге на один бак.
У вас также за какоето время разряжение накапливается в баке или в трубопроводе перед насосом, он просто неможет эфективно приодолеть разрежение и как любой мембранный механический насос просто виснет. Верней всего надо искать где тонкие проходы в шлангах, возможно какойто шланг раскис.