Штриховка в виде квадратиков только чтобы выделить саму мембрану. В данном случае отверстия прямые, а не конусные. И не важно как полетят молекулы и под каим углом. Тут главное - вылетела или не вылетела. Главное, что они будут пролетать через мембрану. Например, молекулы могут пролетать через отверстия, на касаясь стенок. Для таких молекул не важно размеры, форма и прочее мембраны. Пусть даже молекула после столкновения со стенкой отверстия отскочила обратно в сосуд. Ну и что. Просто молекула не вылетела как и те молекулы, которые не попали в отверстия. Не надо из мухи делать слона.