Дело не в сгоревшем материале теплоизоляции, а в разрыве устоявшегося состояния разреженной атмосферы в верхних слоях. Там формируются высотные течения, которые влияют на перенос тепла и сезонные течения в более низких слоях. Их изменение, влияет на погоду над большими пространствами земной поверхности. Это уровень полярных сияний. (предвестников изменения погоды ). Насколько я помню из рассказов человека, участвовавшего в испытаниях гиперзвуковых ракет, после этого, в районе испытаний на неделю менялась погода.
Мне видится негативное влияние в том, что угол входа в атмосферу рассчитан на то, что будет "рикошет" - выскакивание на низкую орбиту для последующего повторного захода и спуска. ( То есть первичное оттормаживание будет производиться не как обычно, с околоземной орбиты двигателями, а "с ходу", с последующим выходом на околоземную орбиту и с неё уже спуск ) При "отскоке" траектория воздействия на атмосферу в разы протяжённее. Да и характер повреждения будет не в виде "прокола" а в виде "разреза" на этом участке.